Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FAS-204ENST00000355740 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms