Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXND1Q9Y4D7 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms