Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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