Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP89Q96ST8 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms