Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms