Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms