Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms