Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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