Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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