Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLK1P49759 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLK1P49759 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLK1P49759 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLK1P49759 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLK1P49759 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLK1P49759 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLK1P49759 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLK1P49759 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLK1P49759 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLK1P49759 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLK1P49759 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLK1P49759 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLK1P49759 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLK1P49759 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CLK1P49759 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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