Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GGCXP38435 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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GGCXP38435 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GGCXP38435 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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