Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms