Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 HGSNAT-201ENST00000379644 5236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 PLEKHA6-201ENST00000272203 7401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RAB4AP20338 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 NIN-201ENST00000245441 10293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ZNF133-215ENST00000630056 1999 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC026369.1-202ENST00000508953 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SMARCA2-258ENST00000637103 5657 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 RASGRF2-201ENST00000265080 8167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 USP10-219ENST00000570191 2717 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ACSL6-207ENST00000379264 6539 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 TIFAB-201ENST00000537858 5923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 KCND2-201ENST00000331113 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 TRMT112-205ENST00000539854 659 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms