Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PPARGC1AQ9UBK2 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PPARGC1AQ9UBK2 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PPARGC1AQ9UBK2 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PPARGC1AQ9UBK2 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PPARGC1AQ9UBK2 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PPARGC1AQ9UBK2 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PPARGC1AQ9UBK2 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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