Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms