Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms