Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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