Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZGT2

NEXN, Nexilin, humanhuman

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXNQ0ZGT2 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEXNQ0ZGT2 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms