Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms