Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CREMQ03060 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CREMQ03060 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CREMQ03060 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CREMQ03060 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CREMQ03060 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CREMQ03060 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CREMQ03060 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CREMQ03060 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CREMQ03060 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms