Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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USP46P62068 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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USP46P62068 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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USP46P62068 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP46P62068 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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