Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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