Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAEP38570 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms