Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 FREM3-201ENST00000329798 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 RNF125-201ENST00000217740 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 NRAP-201ENST00000359988 5580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
IL3RAP26951 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms