Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms