Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC5A1P13866 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC5A1P13866 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC5A1P13866 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC5A1P13866 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC5A1P13866 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC5A1P13866 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC5A1P13866 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC5A1P13866 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC5A1P13866 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC5A1P13866 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC5A1P13866 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC5A1P13866 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC5A1P13866 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms