Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLVAPQ9BX97 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms