Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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