Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms