Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TMEM59-201ENST00000234831 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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RRN3P1Q2M238 ADPRH-204ENST00000478399 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC135012.1-201ENST00000563931 7430 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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