Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PTPRJQ12913 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PTPRJQ12913 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PTPRJQ12913 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PTPRJQ12913 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PTPRJQ12913 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PTPRJQ12913 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PTPRJQ12913 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PTPRJQ12913 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PTPRJQ12913 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PTPRJQ12913 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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