Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms