Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPB2P35606 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPB2P35606 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPB2P35606 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPB2P35606 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
COPB2P35606 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPB2P35606 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPB2P35606 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms