Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF1P21675 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1P21675 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1P21675 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1P21675 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms