Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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