Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 FAM138A-201ENST00000417324 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 FAM138D-201ENST00000504074 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 FAM138E-201ENST00000507796 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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