Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 AC108082.1-201ENST00000510857 331 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 CBX3P4-202ENST00000540428 423 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 AC007608.2-201ENST00000569940 1146 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLA1P09884 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 TRNT1-202ENST00000280591 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 AL133517.1-201ENST00000413412 748 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 AL512444.1-201ENST00000419644 480 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 MTND6P7-201ENST00000433237 524 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 OR2A15P-201ENST00000463814 900 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 RPL26-206ENST00000582556 763 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 AC025165.4-201ENST00000602327 433 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLA1P09884 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLA1P09884 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
POLA1P09884 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 HLA-DRB6-202ENST00000437183 1090 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 AL353803.1-201ENST00000439014 800 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 RPL7AP53-201ENST00000468834 793 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 RN7SL105P-201ENST00000475661 299 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 PXN-AS1-205ENST00000542314 707 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 MIR941-1-201ENST00000636396 72 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 LINC01988-202ENST00000636975 921 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLA1P09884 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLA1P09884 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLA1P09884 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLA1P09884 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLA1P09884 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLA1P09884 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLA1P09884 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLA1P09884 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLA1P09884 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLA1P09884 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLA1P09884 SULT1A3-202ENST00000395138 1326 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLA1P09884 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLA1P09884 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLA1P09884 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLA1P09884 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLA1P09884 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POLA1P09884 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLA1P09884 FXYD2-201ENST00000260287 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLA1P09884 KIR2DL1-201ENST00000291633 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLA1P09884 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms