Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms