Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms