Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZST2

ZCCHC23, Zinc finger CCHC domain-containing protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC23Q6ZST2 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZCCHC23Q6ZST2 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms