Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSPP1Q1MSJ5 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms