Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 410.2 ms