Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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USP46P62068 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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USP46P62068 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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USP46P62068 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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USP46P62068 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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USP46P62068 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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USP46P62068 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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USP46P62068 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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USP46P62068 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP46P62068 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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