Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GJB2P29033 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJB2P29033 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJB2P29033 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJB2P29033 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJB2P29033 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJB2P29033 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJB2P29033 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJB2P29033 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJB2P29033 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJB2P29033 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJB2P29033 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms