Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CST11-202ENST00000377009 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 STEAP2-AS1-202ENST00000478318 627 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC022447.2-201ENST00000509750 543 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SMIM22-201ENST00000586005 366 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms