Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4BP0C0L5 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 IFI27L1-203ENST00000553664 647 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AC138430.2-201ENST00000624068 504 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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