Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2F8A0AVK6 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms