Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PPARGC1AQ9UBK2 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PPARGC1AQ9UBK2 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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PPARGC1AQ9UBK2 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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