Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms