Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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UBE2E2Q96LR5 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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UBE2E2Q96LR5 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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UBE2E2Q96LR5 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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UBE2E2Q96LR5 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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UBE2E2Q96LR5 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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